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第四军医大学是双一流院校。中国人民解放军空军军医大学（第四军医大学）是一所培养高、中层次医学专业人才的全国重点大学。1997年成为国家首批22所“211工程”重点建设院校之一，2017年进入国家“双一流”建设首批一流学科建设院校行列。
学校机关设一办七处，下辖航空航天医学系、军事预防医学系、军事生物医学工程学系、药学系、军事医学心理学系、护理系、基础医学院、研究生院、空军特色医学中心（北京）、空军卫勤训练基地、第一附属医院（西京医院）、第二附属医院（唐都医院）、第三附属医院（口腔医院）、空军第九八六医院等。
学校现有本科学历教育、研究生教育、任职教育3个培训层次。学校是国务院批准的首批博士、硕士学位授权单位，现有博士学位一级授权学科12个，硕士学位一级授权学科12个，并设有10个博士后流动站。目前有6个学科领域进入ESI全球前1%，25个学科排名全国前10名。现有国家重点和培育学科19个，国家重大科研基础设施1个，国家重点实验室2个，国家临床医学研究中心2个，国家临床重点专科军队建设项目23个，全军医学专科中心35个，军队后勤科研实验室19个，全军医学专业重点实验室17个。