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基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定，能在细胞分裂时精确地复制自己，但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在形式基因突变改变成另一种新的存在形式，代替了原有基因，这个过程叫做基因突变。
基因突变的原因：
基因突变，染色体畸变以及DNA的重组和基因的重排，概括起来就是一句话，遗传信息发生改变。突变是遗传物质中不是由于遗传重组产生的任何可遗传的改变，基因突变分为自发突变和诱发突变两类，而造成基因突变的原因主要有以下三点：
1、基因突变可能发生在染色体水平或基因水平，前者称为染色体畸变，后称为基因突变。基因突变可以由于碱基对的置换或者一个或多个碱基的增加和减少而引起。
2、基因突变可能由放射线所引起，放射线通过使染色体断裂产生遗传操损伤。也可由化学物质和DNA的作用而产生，或者由于导致DNA之间异常链的形成而产生。
3、基因突变也可能由某些化学物质所引起，这些化学物质称为化学诱变剂。现已知很多的化学诱变剂，它们诱变的机制是不同的，在DNA复制过程由于碱基类似物的取代，碱基的化学修饰以及碱基的插入和缺失都会引起突变。
另外，从分子水平上看，基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变，基于此造成基因突变的原因还有以下三个因素：(1)物理因素：x射线、激光等 (2)化学因素：亚硝酸和碱基类似物等 (3)生物因素：病毒和某些细菌等。
基因突变的特点：
基因突变具有普遍性、随机性、稀有性、少利多害性和可逆性的特点：
普遍性：基因突变在自然界各物种中普遍存在。
随机性：T.H.摩尔根在饲养的许多红色复眼的果蝇中偶然发现了一只白色复眼的果蝇。这一事实说明基因突变的发生在时间上、在发生这一突变的个体上、在发生突变的基因上，都是随机的。以后在高等植物中所发现的无数突变都说明基因突变的随机性。
稀有性：在第一个突变基因发现时，不是发现若干白色复眼果绳而是只发现一只，说明突变是极为稀有的，也就是说野生型基因以极低的突变率发生基因突变。
可逆性：野生型基因突变成为突变型基因的过程称为正向突变。突变基因又可以通过突变而成为野生型基因，这一过程称为回复突变。正向突变率总是高于回复突变率，这是因为一个野生型基因内部的许多位置上的结构改变都可以导致基因突变，但是一个突变基因内部只有一个位置上的结构改变才能使它恢复原状。
少利多害性：基因突变会产生不利的影响，被淘汰或是死亡，但有极少数会使物种增强适应性。