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不影响。农村地方专项计划在高考填报志愿时需填报本省的相应批次，是单独填报志愿，一般认为，获得高校专项计划录取资格就增加了一次机会。一旦录取后，后面的志愿就作废了;没录取的，后面的志愿是不受影响的。
什么是农村专项
农村专项是一项新的普通高校招生政策，又称贫困地区定向招生专项计划。
贫困地区定向招生专项计划，是由中央部门高校和地方“211工程”高校为主的本科一批招生高校承担，面向全国832个贫困县(简称为贫困地区专项计划)定向招生，给贫困地区的农村孩子更多的上的大学，受教育的机会。这也是解决教育资源不均衡，惠民生的举措，受到贫困地区的农村考生的普遍欢迎。
农村专项计划的好处与不足
1、符合报考条件的农村考生可以报考农村专项计划，参加农村专项计划招生的都是部属或省属的重点院校，要是按照普通考生录取，会高出一本分数线很多分，而农村专项计划一般都是在本科一批分数线上投档录取。
2、报考农村专项计划的优惠政策很大，重点院校基本上都可以优惠30-60分，有的学校甚至达到本科一批分数线就可以录取。
3、利的是招生院校都是好大学，录取分数比正常录取要低。相反专业选择余地比较小。
4、弊端是重点高校招收农村学生专项计划批一般都会和考生签订协议的，毕业之后按协议执行，一般是回生源地工作。但有利的是可以凭借这个计划，有可能分数比较低，就可以进到一所比较好的大学，毕业之后无需找工作。