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不影响。农村地方专项计划在高考填报志愿时需填报本省的相应批次，是单独填报志愿，一般认为，获得高校专项计划录取资格就增加了一次机会。一旦录取后，后面的志愿就作废了；没录取的，后面的志愿是不受影响的。
高考农村专项是针对边远、贫困、民族等地区县（含县级市）以下高中招收勤奋好学、成绩优良的农村学生的计划、国家要求高水平高校拿出计划招收特定的考生，录取时单独划线、单独批次录取。高考农村专项计划包括高校专项计划、国家专项计划和地方专项计划三种类型。
符合报考条件的农村考生可以报考农村专项计划，参加农村专项计划招生的都是部属或省属的重点院校，要是按照普通考生录取，会高出一本分数线很多分，而农村专项计划一般都是在本科一批分数线上投档录取。
报考农村专项计划的优惠政策很大，重点院校基本上都可以优惠30-60分，有的学校甚至达到本科一批分数线就可以录取。