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不会。地方专项计划，一般在本科一批录取后进行投档，所以绝不会影响本科一批录取。各省专项计划的填报形式和填报批次不同，在一定的批次录取。如果考生已被前一批次中的志愿录取，则不参加后续批次的录取。
什么是地方专项计划
地方专项计划是指地方重点高校招收农村学生专项计划。为了增加贫困地区学生接受高等教育的机会，上至国家，下至地方，分别为考生制定了国家专项计划和地方农村专项计划。
其中，“国家专项计划”是2012年起，国家组织实施面向贫困地区定向招生专项计划，即在普通高校招生计划中专门安排适量招生计划，面向集中连片特殊困难地区(以下简称“贫困地区”)生源，实行定向招生。自2014年起，按专项计划录取的新生可自行决定入学时是否签转户口，在校学习期间可按照相关规定和程序申请调整专业。
“地方农村专项计划”则是云南省结合本地实际，安排一定数量的本地所属一本招生高校招生名额，实施招收本省农村学生的地方一本招生高校专项计划。按专项计划录取的考生可自行决定入学时是否签转户口，在校学习期间可按照相关规定和程序申请调整专业。
怎样避免退档
1、考生在填报志愿前，一定要仔细查阅报考院校最新的招生简章程和招生简章，了解高校各个专业对于考生体检结果的要求、外语语种的要求、单科成绩的要求，认真查看学校的录取原则等重要信息。
2、对于自身条件要有一定的认知，包括综合素质评价档案、政审条件、身体素质等方面要有准确的定位。
3、合理设置志愿梯度，不要盲目“冲一冲”，也许你的档案冲进了某个高校，但由于部分学校调档比例超出1:1，而你刚刚踩上投档线或超该校投档线不多，可能被退档;
4、尽量选择“服从专业调剂”。填报服从志愿可以降低被退档的风险，但也可能被调剂到自己不喜欢的学校或者专业。