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不会的。地方专项被退档后，一般是不影响本科批的录取。地方专项计划，一般在本科一批录取后进行投档，所以绝不会影响本科一批录取。各省专项计划的填报形式和填报批次不同，在一定的批次录取。如果考生已被前一批次中的志愿录取，则不参加后续批次的录取。
什么是地方专项计划
地方专项计划是指实施面向贫困地区定向招生专项计划。为了增加贫困地区学生接受高等教育的机会,上至国家,下至地方,分别为考生制定了国家专项计划和地方农村专项计划。
专项计划有很多种类,比如强军计划、援藏计划、农村师资计划、少数民族骨干计划、退役大学生士兵硕士研究生专项计划等,企业制定的实现企业目的的计划等等,科研人员为科研项目而制定的计划等等。
地方专项计划与高校专项计划、国家专项计划的区别
(1)国家专项计划的招生院校是全国重点高校,招生对象面向全国;地方专项计划的招生院校是地方重点院校,招生对象面向本省(区、市)。
(2)高校专项计划的招生院校是教育部直属高校和其他自主招生试点高校,招生对象是农村地区成绩优秀的学生,考生必须经招生院校考核合格才可以报考,我们可以理解成是另一种类型的自主招生。
(3)三大专项计划录取批次不同。一般来说,国家专项计划录取安排在本科提前批,高校专项计划录取安排在自主招生批,地方专项计划录取安排在前两个专项计划之后录取(有的省份安排在本科一批之后录取)。