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呼吸作用通指动植物等需氧生物的组织细胞吸进氧气（或溶解氧），排出二氧化碳的作用；呼吸一般仅指动物通过呼吸器官（如肺、鳃等）从空气或水中获取氧的过程。
1、作用不同
呼吸，是指机体与外界环5261境之间气体交换的过程。人的呼吸过程包括三个互相联系的环节：外呼吸，包括肺通气和肺换气；气体在血液中的运输；内呼吸，指组织细胞与血液间的气体交换。
生物体内的有机物在细胞内经过一系列的氧化分解，最终生成二氧化碳、尿酸或其他产物，并且释放出能量的总过程，叫做呼吸作用。
2、过程不同
呼吸是机体和组织与周围环境交换气体，肺吸入氧气呼出二氧化碳。
呼吸作用，是生物体在细胞内将有机物氧化分解并产生能量的化学过程，是所有的动物和植物都具有的一项生命活动。
3、工作原理不同
呼吸作用是一种酶促氧化反应。虽名为氧化反应，不论有无氧气参与，都可称作呼吸作用（这是因为在化学上，有电子转移的反应过程，皆可称为氧化还原反应）。有氧气参与时的呼吸作用，称之为有氧呼吸；没氧气参与的反应，则称为无氧呼吸。
呼吸是机体和组织与周围环境交换气体的过程，肺吸气和呼气动作的全过程。