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由燕京大学直接拆分而成的大学包括中国政法大学（燕京大学法学院）、中央财经大学（燕京大学经济系）、中央民族大学（燕京大学历史系）。部分由燕京大学直接拆分的，如清华大学工学院等。
在中国高等学校1952年院系调整中，燕京大学被撤消。中国大陆国民政府迁台后，燕京大学在香港被并入香港中文大学。在中国大陆，其资产由中央人民政府接管后被整并，文科、理科多并入北京大学，工科并入清华大学，法科、社会学系并入北京政法学院（已更名中国政法大学）。校舍由北京大学接收，现在其建筑仍为燕京大学古迹。
所以现在主要继承燕京大学的是北京大学。
燕京大学是20世纪初由四所美国及英国基督教教会联合在北京开办的大学，也是近代中国规模最大、质量最好、环境最优美的大学之一，创办于1919年，创始人司徒雷登长期担任燕大校长、校务长。1928年春，燕京大学与美国哈佛大学合作成立哈佛燕京学社，到1930年代已经跻身于世界一流大学之列，在国内外名声大震。