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有氧呼吸是指细胞在氧的参与下，通过多种酶的催化作用，把葡萄糖等有机物彻底氧化分解，产生二氧化碳和水，释放能量，生成大量ATP的过程。
有氧呼吸几个阶段分析
方程式
第一阶段：糖酵解（反应场所：细胞质基质）
①：1 葡萄糖+2ADP+2Pi +2[NAD] → 2丙酮酸+2[NADH+H+]+2ATP
第二阶段：柠檬酸循环（三羧酸循环）（反应场所：线粒体基质）
②：2丙酮酸+2[NAD]+2辅酶A → 2乙酰CoA+2[NADH+H+]+2CO2
③：2乙酰CoA+6H2O+6[NAD]+2[FAD]+2ADP+2Pi →2 辅酶A+6[NADH+H+]+2FADH2+2ATP+4CO2
第三阶段：氧化磷酸化（电子传递链）（反应场所：线粒体内膜）
④：28ADP+28Pi+10[NADH+H+]+2FADH2+6O2 → 28ATP+12H2O+10[NAD]+2[FAD]
第一阶段
在细胞质的基质中，一个分子的葡萄糖分解成两个分子的丙酮酸，同时脱下4个[H](活化氢)；在葡萄糖分解的过程中释放出少量的能量，其中一部分能量用于合成ATP，产生少量的ATP。这一阶段不需要氧的参与，是在细胞质基质中进行的。
反应式：C6H12O6酶→2C3H4O3(丙酮酸)+4[H]+少量能量 (2ATP)（4[H]为4NADH）。
第二阶段
丙酮酸进入线粒体的基质中，两分子丙酮酸和6个水分子中的氢全部脱下，共脱下20个[H]，丙酮酸被氧化分解成二氧化碳；在此过程释放少量的能量，其中一部分用于合成ATP，产生少量的能量。这一阶段也不需要氧的参与，是在线粒体基质中进行的。
反应式：2C3H4O3(丙酮酸)+6H2O酶→20[H]+6CO2+少量能量 (2ATP)（20[H]为16NADH和4FADH2）。
第三阶段
在线粒体的内膜上，前两阶段脱下的共24个[H]与从外界吸收或叶绿体光合作用产生的6个O2结合成水；在此过程中释放大量的能量，其中一部分能量用于合成ATP，产生大量的能量。这一阶段需要氧的参与，是在线粒体内膜上进行的。
反应式：24[H]+6O2酶→12H2O+大量能量(34ATP) （24[H]为10*2NADH和2*FADH2）。
1NADH生成2.5ATP（旧为3ATP），1FADH2生成1.5ATP（旧为2ATP）。
[H]是一种十分简化的表示方式。这一过程中实际上是氧化型辅酶Ⅰ（NAD+）转化成还原性辅酶Ⅰ（NADH + H+），和FAD+转化为FADH2。
有氧呼吸主要在线粒体内,而无氧呼吸主要在细胞基质内。
有氧呼吸需要氧气分子参加,而无氧呼吸不需要氧气分子参加。
有氧呼吸分解产物是能量（ATP）和二氧化碳，水,而无氧呼吸分解产物主要是酒精或乳酸以及少量能量。
有氧呼吸释放能量较多,无氧呼吸释放能量较少。
总反应式
C6H12O6+6H2O+6O2→6CO2+12H2O+大量能量（最多38个ATP，一般是29-30个ATP）
过程中的能量变化
在有氧呼吸过程中，葡萄糖彻底氧化分解，1mol的葡萄糖在彻底氧分解以后，共释放出2870kJ的能量，其中有1161kJ的能量储存在ATP中，1709kJ以热能形式散失。利用率为40.45%。
什么是生物有氧呼吸
生物有氧呼吸是指细胞在氧的参与下，通过多种酶的催化作用，把葡萄糖等有机物彻底氧化分解，产生二氧化碳和水，释放能量，生成大量ATP的过程。有氧呼吸是高等动、植物进行呼吸作用的主要形式，通常所说的呼吸作用就是指有氧呼吸。有氧呼吸在细胞质基质和线粒体中进行，且线粒体是细胞进行有氧呼吸的主要场所。
C6H12O6+6H2O+6O2→6CO2+12H2O+大量能量(最多38个ATP，一般是29-30个ATP)过程中的能量变化在有氧呼吸过程中，葡萄糖彻底氧化分解，1mol的葡萄糖在彻底氧分解以后，共释放出2870kJ的能量，其中有1161kJ的能量储存在ATP中，1709kJ以热能形式散失。利用率为40.45%氧呼吸提供植物生命活动所需要的大部分能量。植物的生长、发育，细胞的分裂和伸长，有机物的运输与合成，矿质营养的吸收和运输等过程都需要能量，这些能量主要是通过植物的呼吸作用提供的。植物的呼吸作用释放能量的速度较慢，而且是逐步释放，适于细胞利用。