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不会。大学中外合作办学硕士的院校和专业，都是经过教育部批准成立之后开办的，招生的对象是中国公民，是国家承认的一种办学形式，不会被歧视的。
中外合作办学硕士找工作会不会被歧视
不会，教育部中外合作办学监管工作信息平台，可以查看中外办学机构及项目名单，能查到就说明是国家认可的项目。只有获得国务院教育行政部门统一编号、统一格式的中外合作办学许可证或者中外合作办学项目批准书的中外合作办学机构和项目可以依法颁发外国教育机构的学历、学位证书。
而且中外合作办学的机构，一般大都是海外名校，国内985院校，所以从证书和学校方面来讲，中外合作办学的硕士认可度是很高的。主要招生对象是内地公民，常见的中外合办硕士项目，大都是采用学校自主招生的模式，不需要经过国家研究生统一考试。修得相应学分后，通过相关考试，毕业后获得外方学校颁发的文凭，通过留服中心的认证，相当于国内双证研究生的效力。
报考的中外合作办学会被歧视吗
我感觉好多中外合作的同学刚进学校的时候都是这个心理反应；但其实没必要的，不会被歧视的，被高看的可能性都要比被歧视的可能性要大！
首先如果统招报考中外合作的专业，说明学习也差不了太多，起码分数线中外合作的一般也就比普通专业低个10分上下的样子； 其次，上了大学就是一个微缩社会了，不像初高中那么纯粹，到了大学，可不是分数论天下的时候了；如果去了中外合作大学，那就更不用担心了，分数也不低，学费也高，可不是每个人都进得去的。
有没有社团经验，情商是不是够高，未来出国，还是考研还是就业；圈子够不够大，是不是学校风云人物...这些事都要比你高考多少分更会影响他人印象...中外合作的同学，接触了这么多，最大的体会是情商大部分还是挺高的，圈子也广，可能是因为大部分同学家里都相对比较富裕，从小到大，父母带他们见过的世界比较广一些，做事方法相对成熟点，所以相对应的对大学适应能力也显然更好些。
当然事无绝对啊，自己好好学习，又有现有的平台作为起点，以后的发展会不错的，不用担心歧视这个问题...要是有谁因为上中外合作办学歧视你，那估计那人内心要么是自卑的，要么就是根本不懂得社会规则，完全可以无视这种人。