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地方专项计划的缺点是招生专业不好;重点高校招收农村学生专项计划批一般都会和考生签订协议的，毕业之后按协议执行，一般是回生源地工作。
地方专项计划的利弊
利：地方专项计划招生更加促进了教育公平，让资源不充分的农村学生得到上大学的机会，接受更多高等的教育。其主要目的是在于扶持以及资助农村大学生，部分地区重点高校还会降低分数进行录取，是有利于农村学生得到就读重点大学的机会。
弊：基本没有什么弊端，但对于高校来说，如何调整计划有一定难度。在农村学生的专业选择和人数方面也有所限制。就业方面，一般毕业后会被建议去贫困地区就业或者回到生源地工作，具体还要看考生自主选择。整体利大于弊。
报考专项计划院校注意事项
1、有的院校允许考生现在多所院校报名，有的则是有所限制。有的规定可以报三所院校，有的规定最多报两所，有的则规定只允许报一所院校，有的院校要求考生在自主招生和高校专项计划二者之间选择一个，不能兼报，这也要考生和家长注意。
2、报名条件
报名条件报考基本报名条件和附加报名条件，基本报名条件一般包括(一)符合统一高考报名条件。
(二)本人及父亲或母亲或法定监护人户籍地在实施区域的农村，本人具有当地连续3年以上户籍。
(三)本人具有户籍所在县高中连续3年学籍并实际就读。这是教育部的规定，是考生必须同时具备的，不具备这些条件不能参加报名。考生是否具备这些条件需要自己清楚，具体可以找有关部门咨询。
附加条件是招生院校自己规定的条件，报考招生地域，有的院校是在全国范围内招生，有的则有限制条件。还包括院校对于考生成绩的要求，报考考生三年总成绩和单科成绩要求等，对于这些考生和家长也要务必注意。
3、高考专项计划都是在提前批或者单列批次填报志愿，如果填报专项计划志愿没有被录取，不会影响其它普通批次学校的录取。
比如一本招生的专项计划学校，会在一本批次前专门设立一个一本专项计划批次填报志愿，如果没有被录取，后面的一本批次志愿照样可以被录取。