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基础医学和临床医学专业大方向不同，基础医学更加偏理论，临床医学更偏实践，学习基础医学也有实践，但一般都是实验课，临床医学则是直接面对病人，需要面对各种突发情况，解决当下发生的事情。而基础医学的方向是深究某个理论，走在临床/实践医学的前面。
基础医学专业和临床医学专业的区别
基础医学专业学制为五年，主要学习自然科学、生命科学和医学科学基本理论知识和实验技能，毕业后能够胜任高等医药院校、科研机构及临床有关实验室的教学和科学研究工作。有志于学习基础医学的考生可提前关注强基计划。该专业无法考取医生执业资格，因此也无法成为医院各个科室中的医生。
临床医学主要研究基础医学、临床医学、手术学等方面的基本知识和技能，进行人类疾病的诊断、治疗、预防等。例如骨折、心脏病等疾病的诊断，心脏搭桥、器官移植等手术的实施，肿瘤的放射治疗等。学科实践性很强，毕业后能在医院、医学科研机构等单位从事临床医疗方面的工作。在学制方面，各校目前培养方案有5~8年不等，5年制为临床医学本科，7年制通常为本硕连读，8年制通常为本硕博连读。
基础医学和临床医学哪个好
基础医学专业，其主要就是属于基础学科，是现代医学的基础;一般来说就是研究人的生命和疾病现象的本质及其规律的自然科学;所以说该专业就是培养一些具备自然科学、生命科学和医学科学基本理论知识和实验技能的学生，故而能够在高等医学院校和医学科研机构等部门从事基础医学各学科的教学、科学研究及基础与临床相结合的医学实验研究工作。
而临床医学专业，则主要就是培养具有研究疾病的病因、诊断、治疗和预后，提高临床治疗水平，促进人体健康的科学;尤其是该专业确实是直接面对疾病、病人，对病人直接实施治疗的，简单点来说就是培养一些偏向于看病或者手术方向的医生。
相比较的情况下，一般临床医学会更受欢迎一些，尤其是在众多高校中选择该专业的比例比起基础医学专业的数量要高出很多，虽然说两者都属于医学类的专业，但发展方向都还是有着些许的区别。
故如果以就业机会和热门程度上来说临床医学会更好一些;基础医学相对来说热门程度就会差一些，但具体还是需要根据选择该专业的学生个人能力、发展方向、学历以及学校实力作为依据的。所以说没有哪个专业绝对比另一个专业好，专业是固定的，但是具体的发展还是依据学生的个人情况。