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民航飞行员和空军飞行员在培养院校上、报名条件上、身体要求上、发展防线上都有不同。民航飞行员在一些高校进行培训，共有19所；空军飞行员在空军航空大学进行培养，属于军校。空军飞行员的待遇比民航飞行员的待遇更好。
民航飞行员和空军飞行员的区别
一、培养院校不同
空军招收的飞行学员将被送到中国人民解放军空军航空大学，学习航空飞行与指挥专业。民航招飞即国航、南航、东航、海航等航空公司委托高校招收飞行学员 ，录取考生在中国民用航空飞行学院、南京航空航天大学等高校学习飞行技术专业。
二、报名条件不同
空军招飞行员以理科生为主，文科生也可报名，但是所占比例较小。民航招飞行员要求考生是理科应届高中毕业男生，文科生和往届生不能报考。
三、身体要求不同
空军飞行员要求考生身高在165-185厘米之间，民航是170-183厘米之间;空军对考生的视力要求是每眼裸眼视力均在C字表0.8以上，而民航飞行员要求0.5以上。
四、未来发展方向不同
空军飞行员是空军部队建设的塔尖，据了解，空军将军大部分是飞行员出身。飞行员通过培养将是空军部队的栋梁之才。民航飞行员将直接分配到航空公司，就业不愁，并且待遇优厚，民航飞行员是国内收入最高的职业之一。
民航飞行员和空军飞行员的待遇不同
一、空军飞行员工作后待遇
(1)行政级别高：初任飞行员即为副连职，资深飞行员最高可至副师职，
(2)随军条件好：不受副营级以下不能随军的限制，个别机种飞行员家属还可以直接在军中安排文职工作。没有随军的每年安排探亲休假一次;单身的飞行员住飞行员公寓，房间设备齐全;
(3)飞行有补助：按飞行小时享受飞行津贴。每小时60-900元。
(4)年年有疗养：一年享受一次度假疗养一个月。
中国军中有句俗话，三个农民养个陆军，三个陆军养个海军，三个海军养个空军;三个空军工程师养个空军飞行员。战斗机飞行员的妻子，还可以特招入伍当军官文职。子女上大学有照顾，如果考不上地方大学，可以安排入军校;空军飞行员到年限了停飞后还有50-80万的停飞补助金。
二、民航飞行员待遇
飞行员待遇根据其级别和所飞机型不同会有所差别，总体上薪水丰厚，副驾驶月薪超过2万元，如果成为正驾驶，或者飞国际航班，收入会成倍增长。
国内的航空公司并没有一个统一的标准，国际航线和国内航线的差距也会比较大，但是不管怎么样，飞行员绝对是个高薪的行业。飞行员的培养成本很高，不少航空公司招聘机长时还会提供各种福利，包括住房，解决小孩上学，配偶工作的问题。