空军工程大学为全国重点大学,是全军重点建设的五所综合大学之一,是空军专业技术最高学府。下辖航空工程学院、防空反导学院、信息与导航学院、研究生院、航空机务士官学校等5个正师级学院(校),空管领航、装备管理与无人机工程等2个副师级学院,以及基础部、军政基础系,形成"六院一校一部一系"总体架构。
学校现有9个一级学科博士学位授权点,17个一级学科硕士学位授权点,4种硕士专业学位授权类型,28个本科专业(方向)。授权学科覆盖了4大学科门类和大学所有主干学科专业,形成了以工学、军事学为主,管理学、理学协调发展,空天网一体化的学科专业体系。拥有2个国家重点学科,5个军队重点学科,1个国家级重点实验室,3个国家级实验教学示范中心,8个博士后科研流动站,10个军队"2110工程"三期重点建设学科专业领域。
学校拥有一支高水平师资队伍和优秀科技创新团队,共有教授、副教授、高级实验师700余人,其中军队科技领军人才培养对象、973首席科学家、国家教学名师、全国优秀教师、百千万人才工程国家级人选及"求是"奖、青年科技奖等获得者70余人。规划在校学员10000余名,其中研究生1500余名。注重学员综合素质全程培养,近年来参加国际国内各类竞赛获奖1000余项,等级数量位居全军院校前列。近几年承担科研项目1100余项,建校以来,共获国家和军队科技奖励近800项。