食品科学与工程专业主要学习课程有《食品工艺学》、《食品分析》、《食品物料学》、《食品工程原理》、《食品机械与设备》、《食品营养学》、《食品保鲜》、《食品包装》等;《无机化学》、《有机化学》、《分析化学》、《物理化学》、《生物化学》、《食品化学》、《微生物学》等;《食品感官评定》、《食品添加剂》、《食品发酵》、《食品质量控制与管理》、《食品加工新技术》、《食品工厂设计》等。
食品科学与工程专业主要培养具有食品科学、食品工程技术、化学、物理学、生物学、计算机应用技术和管理学的基本知识,良好的知识结构和较强的创新精神,能独立从事食品开发、食品生产技术管理、质量控制、工程设计和市场营销等相关企事业部门工程技术和工程管理的高级人才。
开设食品科学与工程的高校由于专业侧重有差别,所以在课程设置上有所区别。以浙江大学为例,食品科学与工程专业学生主要学习化学、生物学和食品工程学的基本理论和基本知识,并接受食品生产技术管理、食品工程设计和科学研究等方面的基本训练。专业核心课程有食品化学与分析、食品营养学、食品微生物学、食品工程原理、食品工艺概论、食品装备与工厂设计等。