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高校专项计划一般都是单列批次填报志愿，填报专项计划志愿不影响填报普通高考志愿。目前都是平行志愿，填报专项计划志愿对其它志愿没有任何影响。如果专项计划志愿与其它志愿填报是同一个批次，也会优先录取其它普通志愿。
高校专项通过初审后应该怎么填报
高校专项计划属于高校自主招生，要提前报名，审核通过后还要参加面试和考试，入选后才可以填报志愿。
高校专项计划通过后只要按照省教育考试院规定的方式填报高考志愿就可以了。已经通过高校专项计划审核的考生，要按照申请院校的要求，本省份教育考试院的具体规定填报高考志愿，由于各省份高考志愿的设置不是完全相同的，考生必须按照本省份的具体要求填报志愿。
自主招生志愿是平行志愿，会根据你填志愿的顺序检索，哪个先检索到能够录取，就录取哪个学校。自主招生志愿可以填多个学校多个专业，具体情况要看你是在哪个省份的。各个省份的自主招生时间是不一样的，具体时间可查看所在省份的教育考试院。
高校专项报考条件
(1)符合本年统一高考报名条件
(2)本人具有实施区域当地连续3年以上户籍，其父亲或母亲或法定监护人具有当地户籍
(3)本人具有户籍所在县高中连续3年学籍并实际就读
报名高考农村专项计划的考生，通过了学校组织的测试后，还需要在高考后填报高考志愿时，填报专项计划报考的学校志愿才能够被录取，而且高考成绩也有一定的要求。
在填报农村专项计划志愿的同时，不影响考生填报其它学校及专业的志愿。
高校专项计划，是国家为更好地促进教育公平、让更多的农村学生上大学而出台的一项优惠政策，主要招收边远、贫困、民族等地区县(含县级市)以下高中勤奋好学、成绩优良的农村学生，具体实施区域由有关省(区、市)确定。高校专项计划与地方专项计划、国家专项计划隶属于高考三大计划。