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民办和独立学院的区别是办学主体不同、办学层次不同、学校名称不同、学历证书不同。从办学主体来看，民办院校的办学主体是社会力量办学，包括个人或者社会机构办学；独立学院的办学主体是普通高校，合作者是社会力量。民办院校是按照民办教育促进法设立的，独立学院是教育行政规章设立的。
独立学院与民办学院的区别
一：办学性质
民办高校是按照民办教育促进法设立的，而独立学院是教育部行政规章设立的。
二：学费
独立学院的学费，每年在10000元以上。
民办高校的学费在10000元——20000元不等。
三：学历层次
独立学院多为民办本科，少部分独立学院也可以招收专科专业。
民办学院专科和本科都很常见。
四：师资资源
民办就是有自己的校名，自己组织机构，自己的师资。
独立学院一般设在某个大学名下，可能和挂名的大学同在一个校园，也可能有师资等方面的共享和交流。
独立学院与民办学校哪个更好
独立学院和民办高校都是三本性质，但是他们却各有各的特点和优势。2003年以前独立学院可以依托母体院校的名气，并且可以共用资源，颁发母体高校的证书，相对更好一些。但是2003年以后经历了改革，一切和往日都存在着不同。同学们无论是想报独立学院还是民办高校，都要做一番调查。
它不可比，各有各的优势，还有它的特点。因为中国的民办高校发展了二十多年，也有一些比较好的学校，像北京的城市学院，吉利大学，等等，独立学院应该说是在民办高校里面算是小弟弟了，时间不是太长，但是独立学院它的优势在于依托于母校的优质的教育资源，它起点比较高，我觉得这是它的优势所在。
应该说是机遇和挑战并存的，如果说挑战，独立学院办学时间还比较短，办学之初依托母体学校的资源，优质教育资源的依托就是将来相对的26号令出台以后，我相信母体学校的支持、指导，包括帮助我们完善评估评价体系，这都肯定还是要继续有的，但是独立授予学位之后也是目前部分家长、学生在选择独立学院的时候，一个比较有想法或者有顾虑的一个问题，这对独立学院来说就要面对这个事情。