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平行志愿按照“分数优先，遵循志愿”的原则进行投档，即谁的分数高，在平行志愿投档时就占有优势，优先投档。投档时，计算机投档系统将严格按照考生的特征成绩分数与政策性照顾分值的总和)从高到低顺序逐个检索、投档。
平行志愿是如何录取的
平行志愿投档原则是：成绩优先，遵循志愿。
在某个招生批次投档前，先将全省同类考生(文、理、体、艺)按高考成绩总分由高分到低分排序。然后从第一名考生开始，依次把考生向其所填的院校志愿中投放，轮到某考生投档时，投档操作运行过程如下：
先检索该生所填报的第一志愿院校计划数是否招满，如没有招满则将该考生的档案投向第一志愿院校。若第一志愿院校已经招满，则检索其第二志愿院校是否已经招满，若未招满则将该考生的档案投向第二志愿院校。
若第二志愿院校已经招满，则检索其第三志愿院校是否已经招满，按照与处理第二志愿完全相同的方式处理第三志愿……当检索处理完该考生的所有志愿后，若该生的档案仍未投出，该生本批次投档结束，该生未能被本批次录取。
由此可见，平行志愿是按考生所填的顺序依次检索考生所填的各个学校的，填在前面的学校先检索，后面的后检索，如果被前面某个志愿学校录取了，那此次录取就结束了，后面的志愿就不起作用了。
平行志愿录取规则解读
“分数优先、遵循志愿、一次投档、不再补档”是平行志愿录取规则最精简的阐述，怎么来理解这句话呢，无外乎三点。
第一：高考总分高的考生先于总分较低的考生投档
每一批次每一阶段院校录取时，考生达到了目标院校(专业)的投档线，就会被投档，目标院校根据投档学生的成绩高低，依次录取，直到录满为止，对于投档成功，但是没有被录取的学生，就会被调剂或者退档。
第二：投档时按考生填报的院校志愿顺序依次进行检索
每个考生的平行院校志愿是有先后顺序的，计算机会按考生填报的志愿排序，依次进行投档，直到考生分数能够进入目标院校的投档线。进入投档线之后，就会按照刚才阐述的第一条进行录取。
第三：多次模拟，一次投档
考生如果在某一批次某一阶段院校录取时，被投档到某个平行志愿院校，但是分数排名靠后，没被录取的话，档案就会被直接退回，不能再参与当前批次的录取了。