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含义不同、语境不同、用法不同。be going to表示近期、眼下就要发生的事情，will be表示的将来时间则较远一些。be going to表示根据主观判断将来肯定发生的事情，willbe表示客观上将来势必发生的事情。
be going to的用法
表示事先经过考虑、安排好打算要做的事情。比如:
What are you going to do today?
今天你们打算做什么？
表示根据目前某种迹象判断，某事非常有可能发生。比如:
I am afraid I am going to have a cold。
恐怕我要患重感冒。
Will的用法
表示单纯的未来“将要”。比如:
They will go to visit the factory tomorrow.
明天他们将去工厂参观。
表示不以人的意志为转移的自然发展的未来的事。比如：
Today is Saturday. Tomorrow will be Sunday.
今天是星期六。明天是（将）是星期日。