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选拔方式、学习年限、占用名额都是不同的。直博即本科生直接攻读博士学位，从校内外的优秀本科生当中进行选拔，能够在本科生阶段获得直博的资格都是佼佼者当中的佼佼者；硕士生入学后，到第二年申请硕博连读，并获得通过后跳过硕士三年级，在硕士三年级的时候自动成为博士一年级。
直博和硕博连读的不同
直博生正常的学习年限是4-6年。硕博连读的正常学习年限是2+3=5年。
直博和硕博连读一致，不需要参加硕士答辩，毕业的时候直接拿博士学位证，没有硕士学位证。如果中途因为各种原因没有拿到博士学位证，硕博连读的学生可以申请转为硕士研究生，退还已经享受的待遇，但是直博的学生如果没有获得博士学位证，不能放弃转硕士（大部分学院是这样的规定，少数学院可能存在差异）。
直博只需要占用导师博士研究生的名额。硕博连读，你是硕士的时候占用导师硕士的招生名额，成为博士的时候占用导师的博士名额。