分子科学与工程专业开设的课程主要有无机化学、有机化学、分析化学、物理化学、结构化学、仪器分析与技术、生物化学、高分子化学、高分子物理、高等无机化学、高等有机化学、无机材料化学、化工原理、化工热力学、化学反应工程、绿色化学工艺学、化工设计、生物化工、化工分离工程、环境化工、化工安全与环保、功能材料物理性能、功能高分子材料、药物分析、材料物理性能、材料结构分析等。
分子科学与工程专业主要培养具有良好人文素质和宽广深厚的化学、化工基础,具有较强的创新意识、基础科学研究能力和功能性化学新产品研发与产业化能力的复合型高素质人才。本专业的学生通过对分子科学与工程专业的基础理论、基本知识的学习和掌握,并受到应用研究方面的科学实验的相关训练,从而具有一定的创新意识和实践操作技能。