江苏财经职业技术学院由原江苏省淮阴财经学校和江苏省淮海工业贸易学校两所学校于2004年7月合并组建而成,江苏省淮阴财经学校起源于1964年创建的淮阴会计职业学校;江苏省淮海工业贸易学校起源于1979年创建的江苏省淮阴粮食技工学校,先后更名为江苏省淮阴粮食学校、江苏省淮海工业贸易学校。
截至2015年12月,江苏财经职业技术学院共设有会计学院、经济贸易学院、工商管理学院、金融学院、人文艺术与法律学院、机械电子与信息工程学院、粮食工程与管理系、思想政治理论课教学科研部和基础教学部等9个院(系、部),开设财、管、贸、文、工、艺等六大门类32个专业及方向。