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没有区别。都是国家教育部认可、颁发并承认的学历证明，换言之，高校毕业证就是只有专科、本科、硕士研究生或者博士研究生等学历之分，而从毕业证上并无体现民办大学还是公办大学之区分！
独立院校和民办院校的毕业证书区别
民办院校和独立院校的区别只有一点就是学院性质不同：
1、民办学校是指国家机构以外的社会组织或者个人，利用非国家财政性经费，面向社会依法举办的学校或其他教育机构。
2、独立学院，是指实施本科以上学历教育的普通高等学校与国家机构以外的社会组织或者个人合作，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等学校，因而独立学院学费是公立大学的三到四倍。