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东南大学有3个校区，分别是：四牌楼校区：南京的中心玄武区四牌楼2号。丁家桥校区：鼓楼区丁家桥。九龙湖校区：江宁经济技术开发区南部。东南大学简称“东大”，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学。
东南大学校区
四牌楼校区：南京的中心玄武区四牌楼2号。校区东枕钟山，北临玄武湖，松桧荟翠，风景秀丽，占地641亩，建有各类建筑61.85万平方米。该校区为研究生教育、本科生高年级教育、继续教育（除医学学科外）和科学技术研究基地。
丁家桥校区：鼓楼区丁家桥。占地176亩，已建各类建筑26万平方米。该校区为医学学科教育科研基地和东南大学附属中大医院所在地。
九龙湖校区：江宁经济技术开发区南部。2006年夏季起，东南大学主教学区迁至东南大学九龙湖校区，总面积3752.35亩。九龙湖校区建筑规划以东南大学的历史文脉为依据，采取公共核心教学组团与专业教学族群组团相结合的校园建筑形态九龙湖校区已建成教学区、科研实验区、行政区、本科生生活区、研究生生活区、教师生活区、后勤保卫区等，总建筑面积约59.9万平方米。