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新疆大学在新疆是第一批次招生，在省外也是第一次批次招生，所以我们通常认为新疆大学是一本大学。新疆大学现有25个学院，1个研究生院，2个教学研究部，36个党政机关及教辅单位。
学校现有经济学、法学、文学、历史学、理学、工学、管理学、艺术学、哲学九个学科门类，涵盖了高级专门人才培养和科学研究的主要领域。现有2个国家级重点学科（中国少数民族语言文学、应用数学），1个国家级重点培育学科（人口、资源与环境经济学），3个双一流重点建设学科（马克思主义理论、化学、计算机科学与技术）；6个自治区级高峰学科，7个自治区高原学科，3个学科（化学学科、工程学科、材料学学科）进入ESI全球前1%；在全国第四轮学科评估中，有7个学科进入B类学科，9个学科进入C类学科。有14个博士学位授权一级学科、34个硕士学位授权一级学科，12个博士后科研流动站，18个硕士专业学位类别，是新疆高校中学位授权最多、学位授权体系最完备的高校。学校现有95个本科专业，70个本科招生专业；14个国家级一流本科专业建设点，10个省级一流本科专业建设点，10个国家特色专业，18个自治区紧缺人才专业，12个自治区重点专业。