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是双一流大学。双一流大学一般指世界一流大学和一流学科。南京大学是世界一流大学建设高校，一流学科：哲学、中国语言文学、外国语言文学、物理学、化学、天文学、大气科学、地质学、生物学、材料科学与工程、计算机科学与技术、化学工程与技术、矿业工程、环境科学与工程、图书情报与档案管理。
南京大学有13个进入ESI排名前1%的学科，分别是：化学、物理学、材料科学、地球科学、生物学与生物化学、临床医学、工程科学、环境科学与生态学、药理学与毒理学、数学、动植物学、计算机科学和农业科学。
教育部公布全国第三轮学科评估结果，南京大学共有32个一级学科参评，其中27个一级学科进入前九，16个学科进入前五，9个学科进入前三，4个学科第二，3个学科第一，在C9高校中排名第三。
世界一流学科建设学科（15个）：哲学、中国语言文学、外国语言文学、物理学、化学、天文学、大气科学、地质学、生物学、材料科学与工程、计算机科学与技术、化学工程与技术、矿业工程、环境科学与工程、图书情报与档案管理。