世界一流建设学科:生物学、生物医学工程、临床医学、药学
国家重点一级学科:生物学、药学
国家重点二级学科:免疫学、病理学与病理生理学、皮肤病与性病学、影像医学与核医学、妇产科学、肿瘤学、麻醉学、内科学
国家重点三级学科:外科学(胸心外)、外科学(骨外)
国家重点(培育)学科:外科学(普外)
国家中医药管理局重点学科:药用植物学
北京市重点一级学科:基础医学、临床医学、护理学、生物医学工程
北京市重点二级学科:神经病学、眼科学、流行病与卫生统计学
北京市重点交叉学科:转化医学
北京市重点三级学科:外科学(普外)