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特点：基因组较小，通常只有一个环形或线形的DNA分子;通常只有一个DNA复制起点;非编码区主要是调控序列;存在可移动的DNA序列;基因密度非常高，基因组中编码区大于非编码区;结构基因没有内含子，多为单拷贝，结构基因无重叠现象。
原核生物基因组特点
1. 基因组多数由环状双链DNA分子组成。
2.具有类核结构。
3.操纵子结构。
操纵子结构(operon)：功能上相关的几个结构基因往往串联排列在一起，受上游共同的调控区和下游转录终止信号所构成的基因表达单位。转录时，几个基因转录在一条mRNA链上,再分别翻译成各自不同的蛋白质。
4.结构基因中无内含子，是与真核细胞的主要区别。编码区基因占基因组比例约50%左右，存在间隔区。
5.DNA绝大部分用于编码蛋白质，结构基因多为单拷贝。
6.结构基因中无重叠现象(一段DNA序列编码几种蛋白质多肽链)。
7.基因组中存在重复序列。
8.基因组中存在可移动的DNA序列，如转座子和质粒等。