1960年,北京大学建立政治学系,1963年改名为国际政治学系。国际关系学院即由此发展而来。1996—1998年,原北京大学国际政治学系、国际关系研究所和亚非研究所经合并调整,组成现在的北京大学国际关系学院。
目前,国际关系学院由5个系和3个研究所组成,即国际政治系、外交学与外事管理系、国际政治经济学系、比较政治学系、国际组织与国际公共政策系、国际关系研究所、亚非研究所、世界社会主义研究所。此外还管理着20多个科研中心。教学辅助机构和行政机构包括院行政办公室、教务办公室、党委办公室、财务办公室、学生工作办公室、国际项目办公室、继续教育办公室、网络办公室、《国际政治研究》编辑部以及北大图书馆国关分馆等。
国际关系学院是北京大学的组成部分,它是北京大学直属的一个本部学院,通俗点来说它就是真正的北京大学的一部分,目前北京大学的国际政治、外交学、政治经济学等专业就开设在该学院。
一个大学本来就是由众多院系组成的,北京大学目前有62个直属院系,国际关系学院就是其中的一个。