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2020年新疆医科大学具体收费标准为：临床医学（“5+3”一体化）专业本科阶段学费4000元/学年、研究生阶段学费根据物价局规定执行；其余本科专业4000/学年；专科专业3900/学年。学生公寓住宿费800/学年。收费标准如有变动以自治区批复为准。
新疆医科大学专业设置情况
| 类别 | 专业 |
| 文学 | 英语 |
| 工学 | 生物医学工程 |
| 医学 | 临床医学、麻醉学、医学影像学、口腔医学、预防医学、中医学、针灸推拿学、维医学、哈医学、中西医临床医学、药学、中药学、护理学 |
| 管理学 | 信息管理与信息系统、公共事业管理 |
| 医药卫生 | 针灸推拿（专科）、护理（专科） |
学费依据来源：新疆医科大学2020年招生章程
（https://gaokao.chsi.com.cn/zsgs/zhangcheng/listVerifedZszc--infoId-2710874776,method-view,schId-594.dhtml）