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2020年商丘医学高等专科学校普通类各专业学费4800元/生/年，对外合作办学专业根据现行合同规定，为12000元/生/年。住宿费:4人间1000元/生/年；6人间800元/生/年。
商丘医学高等专科学校专业设置情况
| 系部 | 简称 |
| 商丘医学高等专科学校临床医学系 | 临床系 |
| 商丘医学高等专科学校口腔医学系 | 口医系 |
| 商丘医学高等专科学校医学技术系 | 医技系 |
| 商丘医学高等专科学校护理系 | 护理系 |
| 商丘医学高等专科学校基础医学部 | 基础部 |
| 商丘医学高等专科学校公共学科部 | 公学部 |
| 商丘医学高等专科学校社会科学部 | 社科部 |
| 商丘医学高等专科学校成教部 | 成教部 |
学费依据来源：
商丘医学高等专科学校2020年普通专科（含对口升学）招生章程
（https://gaokao.chsi.com.cn/zsgs/zhangcheng/listVerifedZszc--infoId-2727610784,method-view,schId-2021.dhtml）