一、清华学堂(1911.4-1912.10)时期没有设立校长,只设立有监督:
二、清华学校(1912.10-1928.8)时期:
唐国安 1912.10-1913.8
周诒春 1913.10-1918.1
张煜全 1918.7-1920.1
金邦正 1920.9-1921.10
曹云祥 1922.4-1927.12
温应星 1928.4-1928.6
三、国立清华大学(1928.8-1937.8)时期:
罗家伦 1928.8-1930.5
吴南轩 1931.4-1931.6
梅贻琦 1931.12-1937.8
四、国立长沙临时大学(1937.10-1938.2由北大清华南开组合)时期 未设校长,设立"常务委员会",由北大、清华、南开三校校长任常务委员 。
五、国立西南联合大学(1938.3-1946.5由北大清华南开组合)时期:
梅贻琦 清华校长(常务会主席) 1938.5-1946.5
六、国立清华大学(1946.10-1948.12)时期:
梅贻琦 1946.10-1948.12
七、清华大学(1949年1月以后)时期中1948.12-1952.11没有设立校长,1967-1977为取消高考时期:
蒋南翔 1952.11-1966.6
刘达 1978.6-1983.5
高景德 1983.5-1988.10
张孝文 1988.10-1994.1
王大中 1994.1-2003.4
顾秉林 2003.4-2012.1
陈吉宁 2012.1-2015.3
邱勇 2015.3-至今
孙家鼐(1898.7-1900.春)
许景澄(1900.春-1900.8)
张百熙(1902.1-1904.1)
张亨嘉(1904.1-1906.2)
李家驹(1906.3-1907.8)
朱益藩(1907.8-1908.1)
刘廷琛(1908.1-1911.12)
柯劭愍(1910.12-1911.12)
劳乃宣(1911.12-1912.2)
严复(1912.2-1912.10)
章士钊(1912.10-1912.12)
何燮侯(1912.12-1913.11)
胡仁源(1913.11-1916.12)
蔡元培(1916.12-1927.7)
刘哲(1927.8-1928.6)
李煜嬴(1928.6-1929.1)
陈大齐(1929.1-1929.8)
蔡元培(1929.9-1930.12)
蒋梦麟(1930.12-1945.10)
胡适(1945.10-1948.12)
汤用彤(1949.5-1951.9)
马寅初(1951.9-1960.3)
陆平(1957.10-1966.5)
周培源(1978.7-1981.3)
张龙翔(1981.6-1984.3)
丁石孙(1984.3-1989.8)
吴树青(1989.8-1996.8)
陈佳洱(1996.7-1999.12)
许智宏(2000.1-2008.11)
周其凤(2008.12-)