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线粒体染色剂是健那绿（或詹纳斯绿B），是一种活体染料，必须保证细胞是活的，才能染色。染料本身无色，进入细胞内的线粒体后被还原成为蓝绿色，使线粒体染色。线粒体中细胞色素氧化酶使染料保持氧化状态（即有色状态）呈蓝绿色，而在周围的细胞质中染料被还原，成为无色状态。
线粒体的功能
除了合成ATP为细胞提供能量等主要功能外，线粒体还承担了许多其他生理功能。
调节膜电位并控制细胞程序性死亡：
细胞增殖与细胞代谢的调控；
合成胆固醇及某些血红素。
线粒体的某些功能只有在特定的组织细胞中才能展现。例如，只有肝脏细胞中的线粒体才具有对氨气（蛋白质代谢过程中产生的废物）造成的毒害解毒的功能。