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三公九卿职责明确，分工协作，提高了办事效率，建立了统一的中央集权国家比较完备的官僚制度。三公九卿之间相互牵制，任何人无法独揽大权，军国大事掌握在皇帝一人之手。
三公九卿的作用
三公
丞相，政府最高行政长官，有一个秘书处十三曹，下辖九卿。
太尉，最高军政长官，负责管理全国军事事务，掌握军权，战时听从皇帝的命令，可凭皇帝的符节调动军队。
御史大夫，主要管理记事，其地位相当于副丞相，地位低于丞相和太尉，主要职责是管理图籍、奏章，监察文武百官。御史大夫下设御史中丞；侍御史，弹劾中央和皇宫一切事；监御史，中央派到地方各郡负责监督郡守的御史。
九卿
九卿是指古时中央政府的多个高级官员，指官位很高的人。秦汉时期的卿，不一定是九个人，九卿言其官职完备。
奉常，掌管宗庙礼仪，地位很高，属九卿之首；
郎中令，掌管宫殿警卫；
卫尉，掌管宫门警卫；
太仆，掌管宫廷御马和国家马政；
廷尉，掌管司法审判；
典客，掌管外交和民族事务；
宗正，掌管皇族、宗室事务；
治粟内史，掌管租税钱谷和财政收支；
少府，掌管专供皇室需用的山海池泽之税及官府手工业。
三公九卿的意义
1、为封建专制主义中央集权国家制度的建立创造了雏形。
2、主要是纵向集权、横向制约，即一方面逐步限制和缩小丞相权力，直至废除丞相。
3、逐步强化监督检查体制，完善制约机制。
4、三公九卿这一制度沿用约达800年，并从结构上影响三省六部制，并左右中国古代中央官制约达700年。可以说，三公九卿制，上承夏商周，下接隋唐宋元，在中国历史上留下了浓重的一笔。