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生命系统的结构层次依次是细胞、组织、器官、系统、个体、种群、群落、生态系统、生物圈。其中细胞属于最基本的生命系统层次，生物圈是最大的生命系统结构层次。
生命系统
生命系统是自然系统的最高级形式，是指能独立与其所处的环境进行物质与能量交换，并在此基础上实现内部的有序性、发展与繁殖的系统。由大到小依次为生物圈、生态系统、群落、种群、个体、（消化、呼吸、循环等）系统、器官、组织、细胞。但单细胞生物（草履虫）不具有系统、器官、组织层次，细胞即是个体；植物是由根、茎、叶、花、果实和种子六大器官直接构成的，因此没有（消化、呼吸、循环等）系统层次；病毒是生物，但不是生命系统。
生命系统结构层次
1、细胞：能独立进行生命活动的有膜包被的生物体的基本结构和功能单位（病毒不含细胞结构）。
2、组织：许多结构相似、功能相似的细胞与细胞间质形成的细胞群叫做组织。
3、器官：具有相似功能的一些组织组成的，能够独立完成某一生命活动的结构叫做器官。
4、系统：多个器官组成的，能够完成某一类生命活动的结构层次叫做系统，植物没有系统。
5、个体：单个生物体成为个体。
6、种群：由同一区域内，某一种生物的所有个体组成的层次叫做种群。
7、群落:由同一区域内，所有生物的所有个体（或所有种群）组成的层次叫做群落。
8、生态系统：由同一区域内，所有生物的所有个体和其生活的无机环境共同组成的层次叫做生态系统。
9、生物圈：范围是大气圈的底部、水圈大部、岩石圈表面、最大的生态系统称生物圈。