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应用本科和普通本科只是教学方式和培养模式不同。应用型本科主要培养突出专业技术较强，社会急缺的高级工程人员，普通本科注重学术研究。
应用本科与普通本科差异
应用本科是高职教育的一个层次，它同一般普通本科相比具有鲜明的技术应用性特征。在培养规格上，应用本科培养的不是学科型、学术型、研究型人才，而是培养适应生产、建设、管理、服务第一线需要的高等技术应用性人才；
在培养模式上，应用本科以适应社会需要为目标，以培养技术应用能力为主线设计学生的知识、能力、素质结构培养方案，以“应用”为主旨和特征构建课程和教学内容体系，重视学生的技术应用能力的培养。
什么是普通本科
普通本科一般指普通高等学校招生全国统一考试招生录取批次。普通高等学校招生全国统一考试招生录取批次是指“本科提前批”、“本科一批”、“本科二批”、“专科一批、“专科二批”等招生批次。中华人民共和国教育部近年积极推动各地开展高校招生录取批次改革，普通高等学校招生录取批次合并体现了国家改革的总体方向。
截至2019年06月，已有北京、上海、天津、河北、浙江、甘肃、江苏、山东、福建、四川、山西、陕西、广西、湖北、江西、辽宁、广东、内蒙、重庆、贵州、河南、安徽、云南、西藏、新疆、宁夏、吉林，27个省（市、区）取消第三批次本科，其中天津分二批AB段、山西分二批A/B/C段，其余省份待定。改革已经取得重要的积极成效，取消批次对减轻基础教育焦虑负担和高考焦虑具有重要深远的意义。