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卫生信息管理专业就业前景很好，卫生信息管理专业的毕业生综合素质强，能够熟练运用现代信息技术，协助卫生管理部门对本单位进行科学管理，就业方向广泛。
国家卫生信息化“十二五规划”报告中指出，卫生信息化发展中存在着缺乏顶层设计和信息标准，信息孤岛和信息瓶颈问题突出;医疗服务机构之间总体协同效果差，信息系统之间缺乏信息共享和业务协作机制，卫生机构从2009年以来采用的分散式系统建设模式，即独立建设系统通常都存在着投资分散而导致的系统质量差、多点维护成本高、建设周期长以及信息准确、安全性能低等一系列问题。构建惠及百姓、服务应用、资源共享、实用互联的卫生信息管理平台迫在眉睫。
卫生信息管理专业已经逐步搭建其公共卫生信息网络，但由于省内卫生信息管理培养途径的缺乏,相当部分的卫生信息管理从业人员是由普通计算机专业、医学相关专业人员转行而成,这部分人员或者不了解相关的医学知识及医疗机构运行机制的特点,或者缺乏对计算机技术的基本了解,且普遍缺乏卫生信息管理学知识,造成不少工作人员对此岗位的不适,无法在卫生经济活动中发挥卫生信息管理人员应有的功能。调研中发现多家医疗机构都明确急需相关的专业人才。