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云南中医药大学是二本，云南中医药大学成立于1960年，是全国第二批成立的高等中医药本科院校，2016年成为云南省人民政府与国家中医药管理局共建高校，2017年通过教育部本科教学审核评估，2018年成为博士学位授予单位，更名为云南中医药大学。
有11个二级学院、1个公共课教学部。有17个国家中医药管理局重点学科、14个省级重点学科，1个中医学一级学科博士学位授权点，4个一级学科（涵盖28个二级学科）硕士点，4个专业硕士学位点。
有27个本科专业，其中，2个国家级特色专业、1个国家级综合改革试点专业，3个省级综合改革试点专业，5个省级特色专业，2个云南八大重点产业引领品牌专业，200余项省级及以上教学质量工程项目。
学校聚焦民族医药、滇南医药、南药研究三大科研集群，有省级重点实验室、工程技术研究中心、中医药临床评价研究中心，工程实验室、公共科技服务平台各1个，省级创新团队2个，有国家中医药管理局中医药科研三级实验室2个，院士专家工作站9个，院士工作站站点1个，省级2011协同创新中心2个，省级中医临床研究基地1个，省哲学社会科学研究基地1个，省技术转移示范机构1个，省高校重点实验室和工程中心8个，省高校科技创新团队5个。学校学报为中国科技核心期刊。