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中外闻名的清华大学所在地原为清代的皇家园林——清华园，起初叫做清华学堂，后更名国立清华大学，新中国成立后去掉国立，正式命名清华大学。
清华一词最早来自东晋谢混作《游西池》诗，有“景昃鸣禽集，水木湛清华”（“湛”通“沉”，音chén），意指“夕阳斜照，鸣叫的鸟儿归林；清澈的水色与华美的草木，已经淹没在暮色之中。”原为感叹时光流逝之意。
后引申出“水木清华”一词，并赋予“池水清澈，树木华美”之意，今日工字厅后匾额即为“水木清华”四字。
明万历年间建皇家园林清华园（今畅春园），后废。清康熙年间建熙春园，后分为近春园、熙春园两部，咸丰帝为熙春园亲书匾额改为“清华园”。
1910年，游美学务处将附属肄业馆改为学堂，依据所在地而定名“清华学堂”。1912年更名为清华学校。
1928年6月，南京国民政府掌控北京后准备改办大学，由于清华接收美国退还庚款，对罗家伦校长的委任状中定名为“清华大学”，未加“国立”二字，后经罗家伦多次争取，最终定名为国立清华大学。1949年新中国成立后，去掉“国立”二字，最终变为“清华大学”。