2002年以后元培计划实验班直接从高考学生中招生。2005年实验班招生156人,其中有17位(文科9位、理科8位)省级高考总分第一名。 2006年实验班招生178人,其中有12位省级高考总分第一名。
元培学院招生与其他院系不同,实行低年级不分专业,按文理两大类招生。学生在全校的学科范围内选择和安排自己的课程与知识结构;在导师指导下根据自己的能力和志趣在全校各个院系的各个专业中自主选择专业。
北京大学元培学院名字不霸气,录取分数线却很高。有一年学校录取了河南理科榜眼,以及某省文科第三名。元培学院是为那些在上大一还不明确自己想学什么的学生准备的。对学生的独处能力要求很高。
在元培学院在大一是过的群体生活,全校的课学生都可以选择性的去上课,然后在大二的时候确定自己的方向,但是别看是一个学院,他的内部结构很复杂。