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东南大学医学院是东南大学的下设二级学院，从历年高考分数线及录取批次上我们通常认为东南大学医学院是二本。
东南大学医学院位于风景秀丽的南京市玄武湖畔，高校群集的市中心。医学院前身为创建于1935年的中央大学医学院，其后又历经南京大学医学院、中国人民解放军第五军医大学、南京铁道医学院等重要时期。
2012年，该院获批为全国第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校，承担了拔尖创新医学人才培养模式改革试点和五年制临床医学人才培养模式改革试点两个项目。
东南大学医学院设有两个系，基础医学系设有生物工程学、病原生物学与免疫学、遗传学与发育生物学、生物化学与分子生物学、病理学与病理生理学、人体结构学与神经科学、生理学与药理学等专业；临床医学系设有内科学、外科学、妇产科学、儿科学、护理学、医学检验学、医学影像学、神经精神病学，肿瘤学、重症医学等临专业；数十个教研室。