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吉林大学珠海学院是一所独立学院，各专业学费不等。2018年学校动画、视觉传达设计、音乐表演、舞蹈编导专业学费均为27000元，中药学、自动化、通信工程、金融学、制药工程等专业学费均为24000元。
吉林大学珠海学院部分专业学费是呈上涨状态的，比如音乐表演、舞蹈编导、动画、视觉传达设计四个专业针对2015级学生的收费标准是23000元，2016级是24000元，2017级是26000元，2018级是27000元。
吉大珠海学院有些专业学费是成等差数列递增的，2015级收费标准是18000元，2016级是20000元，2017级是22000元，2018级是24000元，这样的专业主要有：
信息管理与信息系统、市场营销、旅游管理、电子商务、电子信息科学与技术、计算机科学与技术、国际经济与贸易、汽车服务工程、物流管理、汉语言文学、广告学、英语、软件工程、机械设计制造及其自动化、工商管理、劳动与社会保障、行政管理、日语、人力资源管理、药物制剂、朝鲜语、制药工程、金融学、汉语国际教育、网络工程、应用化学、自动化、中药学、微电子科学与工程、化学工程与工艺、通信工程、社会工作、会计学、工业工程、车辆工程、测控技术与仪器等。
2018级金融工程、机械电子工程、应用统计学、体育教育、药物分析等专业收费标准是24000元。工商管理2+2中外学分互认项目、酒店管理2+2中外学分互认项目等最新收费标准是34000元。在住宿费方面，2018级4人每生每学年2000元，水电费需要自己交。