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2025年甘肃中医药大学王牌专业包括：国家级特色专业、国家级一流专业、省级一流专业。其中国家级特色专业有：针灸推拿学专业、中西医临床医学专业、中草药栽培与鉴定专业，国家级一流专业有：中药学专业、中西医临床医学专业、医学信息工程专业，省级一流专业有：中草药栽培与鉴定专业、医学检验技术专业、藏医学专业。
甘肃中医药大学国家级特色专业
国家级特色专业包含：针灸推拿学、中西医临床医学、中草药栽培与鉴定等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 针灸推拿学 |
| 2 | 中西医临床医学 |
| 3 | 中草药栽培与鉴定 |
甘肃中医药大学国家级一流专业
国家级一流专业包含：中药学、中西医临床医学、医学信息工程等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 中药学 |
| 2 | 中西医临床医学 |
| 3 | 医学信息工程 |
| 4 | 中医学 |
甘肃中医药大学省级一流专业
省级一流专业包含：中草药栽培与鉴定、医学检验技术、藏医学等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 中草药栽培与鉴定 |
| 2 | 医学检验技术 |
| 3 | 藏医学 |
| 4 | 预防医学 |
| 5 | 护理学 |
| 6 | 医学影像学 |
| 7 | 针灸推拿学 |
| 8 | 临床医学 |
| 9 | 康复治疗学 |
| 10 | 中药资源与开发 |