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中国科学技术大学作为一所非常有特色的高校，其王牌分专业凭借行业优势、就业率及工资水平，成为考生与家长在志愿填报时关注的重点点。结合专业实力、就业前景及毕业生反馈，以下王牌专业尤为突出：
中国科学技术大学国家级特色专业
国家级特色专业包含：生物科学、信息安全、化学等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 生物科学 |
| 2 | 信息安全 |
| 3 | 化学 |
| 4 | 数学类 |
| 5 | 地球物理学 |
| 6 | 计算机科学与技术 |
| 7 | 物理学 |
| 8 | 电子信息工程 |
| 9 | 软件工程(设2个专业方向) |
中国科学技术大学国家级一流专业
国家级一流专业包含：光电信息科学与工程、大气科学、生物科学等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 光电信息科学与工程 |
| 2 | 大气科学 |
| 3 | 生物科学 |
| 4 | 能源与动力工程 |
| 5 | 材料物理 |
| 6 | 理论与应用力学 |
| 7 | 信息安全 |
| 8 | 生物技术 |
| 9 | 地球化学 |
| 10 | 高分子材料与工程 |
| 11 | 核工程与核技术 |
| 12 | 管理科学 |
| 13 | 安全工程 |
| 14 | 计算机科学与技术 |
| 15 | 化学 |
| 16 | 金融学 |
| 17 | 电子科学与技术 |
| 18 | 自动化 |
| 19 | 应用物理学 |
| 20 | 测控技术与仪器 |
| 21 | 地球物理学 |
| 22 | 信息与计算科学 |
| 23 | 电子信息工程 |
| 24 | 工商管理 |
| 25 | 数学与应用数学 |
| 26 | 天文学 |
| 27 | 物理学 |
| 28 | 统计学 |
| 29 | 机械设计制造及其自动化 |
中国科学技术大学省级一流专业
省级一流专业包含：工程物理、临床医学、环境科学与工程等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 工程物理 |
| 2 | 临床医学 |
| 3 | 环境科学与工程 |
| 4 | 数据科学与大数据技术 |
| 5 | 传播学 |
| 6 | 网络与新媒体 |
| 7 | 量子信息科学 |
| 8 | 人工智能 |
| 9 | 通信工程 |
| 10 | 材料化学 |
| 11 | 环境科学 |