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2025年南京审计大学王牌专业包括：国家级特色专业、国家级一流专业、省级一流专业。其中国家级特色专业有：金融学专业、审计学专业、财政学专业，国家级一流专业有：电子商务专业、劳动与社会保障专业、信用管理专业，省级一流专业有：市场营销专业、保险学专业、软件工程专业。
南京审计大学国家级特色专业
国家级特色专业包含：金融学、审计学、财政学等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 金融学 |
| 2 | 审计学 |
| 3 | 财政学 |
南京审计大学国家级一流专业
国家级一流专业包含：电子商务、劳动与社会保障、信用管理等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 电子商务 |
| 2 | 劳动与社会保障 |
| 3 | 信用管理 |
| 4 | 物流管理 |
| 5 | 会计学 |
| 6 | 行政管理 |
| 7 | 经济学 |
| 8 | 信息管理与信息系统 |
| 9 | 计算机科学与技术 |
| 10 | 财政学 |
| 11 | 金融学 |
| 12 | 财务管理 |
| 13 | 审计学 |
| 14 | 国际经济与贸易 |
| 15 | 法学 |
| 16 | 工商管理 |
| 17 | 经济统计学 |
| 18 | 投资学 |
南京审计大学省级一流专业
省级一流专业包含：市场营销、保险学、软件工程等。
| 序号 | 专业名称 |
|---|---|
| 1 | 市场营销 |
| 2 | 保险学 |
| 3 | 软件工程 |
| 4 | 金融数学 |
| 5 | 英语 |
| 6 | 汉语言文学 |
| 7 | 税收学 |
| 8 | 数学与应用数学 |
| 9 | 人力资源管理 |
| 10 | 汉语国际教育 |
| 11 | 工程管理 |